La estructura organizacional-funcional del ILANUD está conformada por:
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Un Consejo Asesor Internacional que funciona como vÃnculo entre la Comisión de las Naciones Unidas para la Prevención del Delito y Justicia Penal, y los paÃses de América Latina y el Caribe. Está conformado por la Dirección de la División de Tratados de UNODC, el Director Emérito y el Director en ejercicio del ILANUD, los Ministros de Justicia y Procuradores Generales de los gobiernos que actualmente tienen representantes regionales ante la Comisión; al mes de abril de 2007 los paÃses son: Argentina, Bolivia, Brasil, Costa Rica, Ecuador, Jamaica, México y Perú. Adicionalmente integran el Consejo diez reconocidos expertos internacionales especialistas en materias relacionadas con los ámbitos de acción del Instituto.
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Una Dirección compuesta por un director, un asesor en cooperación internacional y otro en gestión administrativa.
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Una estructura de programas y proyectos y un centro de documentación (CEDO) en lÃnea especializado.
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Un equipo de consultores y expertos en su sede y una red regional de expertos y consultores encargados de prestar asistencia técnica especializada para la formulación, ejecución y evaluación de proyectos en su esfera de acción
